.. title: COVIDíme: Zplošťujeme neexistujícící křivku?
.. author: Jan Janský
.. date: 2020-03-31
.. tags: myšlenka, analýza, věda, konspirace, covid-19
.. previewimage: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/cr-testy.png

.. thumbnail:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/cr-testy.png
   :align: right
   :alt: Počet všech a pozitivních testů na SARS-CoV-2

Jako zdůvodnění plošné karantény a omezení občanských svobod v ČR i na světě v
reakci na šíření viru *SARS-CoV-2* se udává tzn. *zplošťování křivky* šíření
nákazy.  Jednoduše jde o to, aby fáze exponenciálního šíření nákazy měla co
nejnižší násobný koeficient, aby se nemoc šířila co nejpomaleji a nedošlo k
přetížení zdravotnického systému.  Pohled na statistiku prováděných testů —
jediných dostupných indikátorů šíření nákazy — však vyvolává zásadní otázky
jak s ohledem na rozšíření nákazy, tak na účinnost, a tedy smysl, zavedených
karanténních opatření.

.. TEASER_END


Co lze od testů očekávat
========================

Jak je možné zjistit šíření nemoci (viru) v populaci?  Testováním.  Máme-li
ustálenou metodologii testování (výběr jedinců, způsob testování), pak by se
*změna poměrného promoření populace* měla v prováděných testech objevit
*změnou míry pozitivních případů*.

Jsme-li na začátku epidemie, která se teprve začíná ve společnosti šířit,
bude procento pozitivních testů menší, než v případě, kdy je epidemie na
vrcholu.

Například, řekněme, že symptomem nemoci (přítomnosti viru) je horečka, dušnost
a kašel.  Tyto symptomy mohou mít mnoho příčin *z nichž pouze jednou je vir,
který nás zajímá*.

Pokud testujeme lidi s těmito příznaky *na začátku* epidemie, procentní výskyt
hledaného viru (jedné z příčin) bude *malý*.  *Poté*, co se vir rozšíří, nutně
musí být v množině testovaných lidí jeho procentní výskyt *větší*.  Z toho
plyne důležitý závěr:

  Pokud se mění výskyt viru v populaci, pak prováděné testy — pokud jsou
  platné a mají stabilní metodologii — musí zrcadlit poměrné rozšíření viru v
  populaci.

Z nějakého důvodu to však u stávající "pandemie" nemoci COVID-19 způsobované
virem SARS-CoV-2 neplatí.  Minimálně ne pro země, k nimž jsem byl schopen
dohledat alespoň základní statistiku množství a výsledků prováděných testů.


Jaké jsou reálné výsledky
=========================

Z dostupných oficiální dat [#]_ pro Českou republiku, USA a Itálii má *procentní
zastoupení pozitivních testů* na SARS-CoV-2 následující průběh:

.. figure:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/srovnani-pc-positive.png
   :target: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/srovnani-pc-positive.png
   :align: center
   :alt: Vývoj procentního zastoupení pozitivních testů na SARS-CoV-2

   *Vývoj procentního zastoupení pozitivních testů na SARS-CoV-2 v ČR, USA a
   Itálii.*

Aktuální procento pozitivních testů zde zřetelně neodpovídá očekávání.
Například v druhé půlce března v ČR *by mělo být patrné* zvýšení procenta
pozitivních testů, jelikož právě to je období, v němž se u lidí, nakažených
před zavedením karantény, dal očekávat výskyt příznaků.  Namísto nárůstu však
sledujeme setrvalý stav v rozmezí 6-7%, na konci měsíce dokonce znatelný
pokles.

V Itálii, s výjimkou několika "anomálních dní" máme opět — víceméně konstantní
procento pozitivních testů.

I v USA, kde podle oficiálních zpráv dochází v druhé polovině března k
exponenciálnímu šíření nemoci, zaznamenáváme změnu procenta pozitivních testů
pouze v řádech procent.

Bez ohledu na prováděný počet testů pak v průběhu času, v němž *by mělo
poměrně přibýt pozitivních jedinců*, zůstává procento pozitivních testů
víceméně konstantní.  Denní počty testovaných a procento pozitivních jedinců v
ČR shrnuje následující graf.

.. figure:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/cr-pocet-pomer.png
   :target: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/cr-pocet-pomer.png
   :align: center
   :alt: Vývoj počtu prováděných a procenta pozitivních testů v ČR.

   *Vývoj počtu prováděných a procenta pozitivních testů v ČR.*

Nyní, položíme-li "přes sebe" křivku počtu všech testů a křivku pozitivních
testů, zjistíme, že se v našich třech zemích *téměř dokonale kryjí* (včetně
New Yorku, "epicentra" nákazy v USA):

.. figure:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/cr-testy.png
   :target: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/cr-testy.png
   :align: center
   :alt: Počet všech a pozitivních testů v ČR

   *Počet všech a pozitivních testů v ČR.*

.. figure:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/usa-testy.png
   :target: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/usa-testy.png
   :align: center
   :alt: Počet všech a pozitivních testů v USA

   *Počet všech a pozitivních testů v ČR.*

.. figure:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/usa-ny-testy.png
   :target: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/usa-ny-testy.png
   :align: center
   :alt: Počet všech a pozitivních testů v USA v New Yorku

   *Počet všech a pozitivních testů v USA ve státě New York.*

.. figure:: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/it-testy.png
   :target: /media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/it-testy.png
   :align: center
   :alt: Počet všech a pozitivních testů v Itálii

   *Počet všech a pozitivních testů v Itálii.*


Toto považuji za *naprosto anomální výsledek*, který je *v rozporu s
exponenciálně se šířící nemocí*.  V případě dramatického vývoje "promoření"
populace by se dané křivky prostě nemohly takto krýt.  Uvedená data ukazují,
že:

  Dle testů zůstává procento infikované populace konstantní.  Informace o
  celkovém počtu infikovaných jedinců je v téměř neměnném poměru k počtu
  provedených testů.

Vysvětlení této *anomálie* (?) mohou být v zásadě tři:

1. V průběhu času se zásadně měnila metodologie testů — a paradoxně *právě
   tak*, aby zcela zakryla šíření nemoci v populaci.

2. V průběhu epidemie SARS-Cov-2 došlo k současné epidemii všech ostatních
   chorob se stejnými symptomy, splňující výběr jedinců pro testování. [#]_

3. Koukáme na výsledek testování v populaci, která je virem *již
   promořena*. [#]_

Nevím, jak vám, ale body 1. a 2. mi nepřijdou příliš pravděpodobné.


Závěrem
=======

Z "oficiálních zdrojů" dat typu `John Hopkins Coronavirus Resource Center
<https://coronavirus.jhu.edu/map.html>`__ se v médiích dozvídáme o
exponenciálním šíření nákazy a o nutnosti "zploštit její křivku".  Je nutné
zavést karanténu, a zastavit vše, co se hýbe.  To by se dalo pochopit i
přijmout.  Jenže, co už se přijmout nesmí, je záměrná manipulace s daty a
šíření *opravdových fake-news* — zamlčováním dvou klíčových informací.

*Zaprvé*, že reportované počty nakažených naprosto neodpovídají skutečnosti.
Jde totiž jen o *počty pozitivních testů*, které:

- *nerozlišují mezi infikovanými a nemocnými*,

- neberou v potaz *bezpříznakový průběh* COVID-19 u přibližně poloviny
  infikovaných [#]_ ("nemocní" si prostě ani nevšimnou, že jsou nemocní) a

- neberou v potaz lidi, kteří s "mírným nachlazením" nemoc "přechodí".

Lze proto očekávat, že počet "nakažených" bude minimálně o řád vyšší — a
reálné ohrožení z nemoci plynoucí o poznání nižší.

*A zadruhé*, informace o exponenciálním šíření nemoci *podle dostupných dat*
vypadá jako založena *pouze na exponenciálním nárůstu testů*, nikoli na
skutečném rozšíření nemoci.  Zvláště v případě, že existují poukazy na její
přítomnost v západních zemích již na podzim r. 2019. [#]_

Zůstává tedy otázka, jakou že to křivku vlastně aktuálně "zplošťujeme".
*Existuje vůbec?* Není tou křivkou nakonec něco, jako `konstantní funkce
<https://cs.wikipedia.org/wiki/Konstantn%C3%AD_funkce>`__?

Detailnější rozbor situace je nad rámec tohoto krátkého upozornění na
"statistickou anomálii" a bude předmětem případných dalších textů.

S přáním otevřených očí a bystré mysli.

— snílek

.. [#] Jako zdroje dat jsem použil rozcenstník na `Our World in Data
       <https://ourworldindata.org/coronavirus-testing-source-data>`__, pro
       data ČR pak oficiální stránku Ministerstva zdravotnictví `COVID-19 v
       ČR: Otevřené datové sady
       <https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v1/covid-19>`__, pro USA data
       z CDC ze stránky `The COVID Tracking Project
       <https://covidtracking.com/>`__ a pro Itálii přehledovou tabulku z
       wikistránky `2020 coronavirus pandemic in Italy
       <https://en.wikipedia.org/wiki/2020_coronavirus_pandemic_in_Italy>`__.

       Bohužel pro většinu dalších zajímavých zemí jsem nebyl schopen data v
       přiměřené době nalézt (ani výše uvedených rozcestník nepomohl).
       Poskytovaná data byla většinou kumulativní a bez informací o
       provedených testech.

       Celý "můj" dataset k 30. březnu 2020 je ke stažení také `zde
       </media/notes/covidime-zplostujeme-neexistujici-krivku/covid-testing-20200330.zip>`__.

.. [#] Což je pochopitelně absurdní.  Á propós, v Itálii letos, s okamžikem
       nástupu kalamity COVID-19, např. prakticky `zmizela chřipka
       <https://app.powerbi.com/view?r=eyJrIjoiMTEyZmM0NGItNjU3OS00YzgzLTgwMDYtNjQ4OWJlNjNkMGZhIiwidCI6ImY2MTBjMGI3LWJkMjQtNGIzOS04MTBiLTNkYzI4MGFmYjU5MCIsImMiOjh9>`__.

.. [#] Zbývá možnost, že jde o virtuální čísla, o podvod.

.. [#] Vizte např. studii *Estimating the asymptomatic proportion of
       coronavirus disease 2019 (COVID-19) cases on board the Diamond Princess
       cruise ship, Yokohama, Japan, 2020*, `eurosurveillance.org
       <https://eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.10.2000180>`__.

.. [#] Spojte si to s informací, že díky pitvám dříve zemřelých dnes pomalu
       vyplouvají na povrch informace o tom, že COVID-19 byl v USA i v Itálii
       už v říjnu 2019.
